Początki historii gdyńskiej akademii wojskowej sięgają okresu międzywojennego, kiedy w 1922r. utworzono w Toruniu Oficerską Szkołę Marynarki Wojennej.

Miała ona kształcić wykwalifikowane służby oficerskie dla odbudowywanej Marynarki Wojennej. Do wybuchu II wojny światowej, wykształcono w oparciu o własny system szkoleniowy, ponad 200 oficerów marynarki. Podczas wojny szkoła działała na terytorium Wielkiej Brytanii, po zakończeniu II wojny światowej szkoła oficerska wznowiła działalność w kraju, starając się o utworzenie szkoły wyższej.

W 1987r. działająca wtedy Wyższa Szkoła Marynarki Wojennej, zostaje przemianowana na obecną nazwę Akademii Marynarki Wojennej. Obecnie akademia prowadzi cztery wydziały, na których oprócz podoficerów, kształcą się również oficerzy, ale również studenci cywilni, którzy po raz pierwszy w historii rozpoczęli studia na uczelni wojskowej w 1996r. Nowoczesne symulatory i laboratoria pozwalają studentom zdobyć niezbędne umiejętności praktyczne, gdzie nabierają umiejętności nawigacyjnych czy poznają tajniki uzbrojenia. Pięciowydziałowa struktura akademii oferuje studentom cywilnym kilkanaście kierunków studiów.